In Design2.0.2の自動ノンブルエラーについて

初めて利用します。

ちょっと古いソフトなのですがwindows(XP)のIn Design2.0.2でブックからPDF書き出しをした際に自動ノンブル設定が反映されず、マスターにあるデフォルト数値が出てしまいました。
PDFに書き出す前のデータは正常でした。

・何百件と制作していて初めての事例（フォーマットは流用）
・サイド別の日に同じブックから書き出した際には正常に書き出せた

どなたか解決策を知りませんか？
また起きるかと思うと恐ろしいです。

既出でしたら申し訳ございません。検索サイトでうまく探し出せなかったのです。

こちらでは解決策をご存知の方がいらっしゃらないようなのでDTP駆け込み寺さまの方にも質問を投げかけさせていただきます。