3.0.1の件

皆様、いろいろとご指摘ありがとうございます。

CS、CS3のバージョンとその中のアプリによっては、アンインストーラーがありますのでそれを使ってやっています。以前のMacのようにゴミ箱に捨てればいいものもありますが、それでもライブラリ中のPreferenceやSettingが消えないものもありますので、注意はしています。
あと、考えられるのはCS2やCS3のアクティベーションが引っ掛かっているのかも知れません。
完全にスッキリさせないとだめなのは確かでしょう。
インストールに際して、バージョンの古いものから順にインストールというのを守ればよかったのでしょうが、仕事の都合で先にInDesignCS3を使う必要があったためです。
その後、CSとCS2のデータの改訂があったものですから。まあ気長に直していきます。
CSについては、もうAdobeではサポートしていただけませんので、今回のヘルプとなった次第です。

ご多忙にもかかわらず、皆様ありがとうございました。

皆様、お世話様でした。

一応、解決しましたのでご報告いたします。
現状、トラブルをおこしたのがOSX10.4.11でしたが、初めてInDesign CSをインストールしたのは10.3.2の時でした。その後，10.3.9か10.4.6のあたりで、CSを3.0.1にアップデートしたと思います。そして10.4.11にしてから使い続けていて、何も問題は起きなかった訳です。

今回、同時にインストールしたイラストレーターCSも、11.0.0から11.0.1にアップデートしようとすると、アップデータが強制終了してしまう現象が起こりました。
もしかしたら、OSXのバージョンが原因ではないかと考えて、別の内蔵HDに10.4.6をインストール、そこから起動してアップデートしてみると、InDesignもイラストレーターもちゃんとアップデートできました！

本当にこれが原因かどうか不明ですが、10.4.11ではCSへのアップデータはうまく動かないのかもしれません。他のマシンでも同じような現象と解決を見るかどうかは、わかりません。