いつも参考にさせて頂いています。

表題の件についてなのですが、
今迄イラストレーターデータを割り付ける際、必ずepsにしてから、インデザインで画像ボックスをキッチリ作って、そこへ割り付け、オブジェクトサイズの調整から"内容を中央に揃える"で、画像ボックスの真ん中に貼り込んでいました。
（イラレもインデザも、バージョン問わずずっとそうしています）

でも、イラストレーターをepsにすると非常に重たくなるので、aiのまま割付よう、と思って同じ手順でやってみたのですが、今迄問題なく出来た"内容を中央に揃える"が、ちゃんと中央に収まらなくなってしまいました。
イラレデータの裁ち落としの部分が切れてしまったり、ズレてしまったり…
（もちろんイラストレータ上ではインデザ画像ボックスのぴったり中央にくるように作ってあります）

どうしたらちゃんと中央にくるように出来るのか、わかりましたら教えて下さい。

説明がヘタでわかりにくかったらすいません…