ファイルメニューの「配置」コマンドから配置しているのでしたら、
コピー＆ペーストで配置すると、どうでしょうか？

また、文字化けするのはどういった文字ですか？

お返事ありがとうございます。早速、両方試したのですがやはりダメでした。　すいません、文字化けと言うより文字が数カ所消えていたり、文字の並びが崩れてたりとメールでお伝えするのが大変難しい状態になってしまっています。何ぶんInDesignは初心者なので、やり方にかなり問題があると思うのですが…
もう少し自分なりに勉強して、トライしてみようと思います。
またよいアドバイスがございましたら、宜しくお願い致します。