タグはInDesign上で付けるよりも、なにかしらのDBを介した方がいいと思うのですが…
という意味で何をされたいのかよく分からない部分もありますので、思わぬ不都合がありかもしれません。
とりあえず。


var my_doc = app.activeDocument;
var my_textFrame = my_doc.selection[0].parentTextFrames[0];
var my_txt = my_doc.selection[0];

var my_root = my_doc.xmlElements[0];//Root要素

var my_textFrame_element = my_textFrame.associatedXMLElement;
if (my_textFrame_element === null) {
   my_textFrame_element = my_root.xmlElements.add("textFrame");
   my_textFrame_element.markup(my_textFrame);
}

var my_txt_element = my_txt.associatedXMLElements[1];
my_txt_element = my_textFrame_element.xmlElements.add("item");
my_txt_element.markup(my_txt);

せうぞーさま

手動で行うのとまったく同じことが出来ました。
ありがとうございます！感激です。

既に完成しているファイルに規則性のない部分にユニークIDをふる作業のためDBを介す等は無理そうでしたのでこういう形にしていました。


markup()や、エレメントはxmlタグと同じ事というのは理解できましたが、一ヵ所理解できないのですが10行目の
var my_txt_element = my_txt.associatedXMLElements[1];
というのにはどんな意味があるのでしょうか。
もしよろしかったら教えていただけませんでしょうか？

あー、すいません。それは（上のテキストフレームの例と同様に）同じ文字列オブジェクトがすでにタグ付けされているときには処理しないようにと考えた残骸です。
現実的にいろんな重複もあり得るわけで、考えていたら煮えて来たのでさっくり削除しました。
その行を削除して
var my_txt_element = my_textFrame_element.xmlElements.add("item");
だけでもいいかもしれません。よくないかもしれませんけれど^^

せうぞーさま

わかりました、問題は無さそうです。
ありがとうございました！