WindowsXP sp3
InDesignCS5 7.0.2

いちど閉じて開いてみたところ、こちらでもアラートが出ました。
再び開くと問題なし。
5分放置のほうは、こちらでは再現しないようです。

解決していませんが、様子を見て、Adobeに不具合フォームで報告しようと思います。

Mac OS 10.6.4
InDesign CS5 7.0.2

この環境でも再現しました。５分くらい放置も１度だけ再現しています。
このとき
/ユーザ/<ユーザ名>/ライブラリ/Preferences/Adobe InDesign/Version 7.0-J/ja_JP/CompositeFont
のフォルダの中にはAdobeFnt13.lstのみで、obiとか合成フォント名のファイルがありませんでした。
ここに合成フォント名のファイルが作成されたあとは問題が発生しなくなるようです。
（繰り返し検証していないので、要確認ですが．．．）

いきさん、こにさん、ご報告ありがとうございます。

決定的な不具合とは言えないのでしょうが、
どうも気持ちが悪いですね。

ちょうど7.03のアップデートが出たようなので、
また少し試してみます。

InDesign CS5 7.0.3と一緒にInDesign CS4 6.0.6のアップデートがでましたね。（相変わらずリリースノートのリリースがまだで、どこを変更したのか内緒状態ですが．．．）
すでにCS4に移行したシリーズはアップデートをしばらく見送りです。

InDesign CS4  6.0.6リリースノート
http://kb2.adobe.com/jp/releasenotes/871/cpsid_87110.html

InDesign CS5  7.0.3リリースノート
http://kb2.adobe.com/jp/releasenotes/870/cpsid_87077.html

合成フォントの件は、こにさんのNo.5150の書き込みの状況と何ら変わっていないのではないかと。

いきさん　リリースノートの情報ありがとうございます。
InDesign CS4 Update Read Me.pdfのリンク先は更新されてないのに。いつもながら情報の配信の仕方がちぐはぐですね。

合成フォントの挙動は後ほど確認してみます。

合成フォントの件　CS5 7.0.3でも再現しますね。
InDesign CS5を起動して新規ドキュメント作成。
適当にテキストを入力して、合成フォントを作成して適用。
この時点で、No.5150に書いたパスに合成フォント名のファイルが作成されます。
ファイル保存して、InDesignを終了。
再度InDesignを起動してファイルを開く。
そのまましばらく放置（クッキングタイマーが無いので３分間程度）。
突然「環境に無いフォント」ダイアログが表示され、合成フォント名のファイルも消えている。
InDesignを終了せず、ドキュメントを閉じて再度開き直すと問題なさそうです。
しかし、InDesignをいったん終了して再度InDesignを起動してファイルを開き、しばらく放置後にはまた現象が再現します。
これは確実にバグですね。報告しましょう。
命名：クッキングタイマーバグ（冗談ｗ）