毎度どうも、質問かみくだきマンです。

片方のドキュメントの末尾ページ（もしくは任意のページ間とか）に、もう一方のページ群を連結させたい、という事ですかね？

じゃなきゃドキュメントAのページaの中に、ドキュメントBのページbの内容を混ぜこんじゃうって意味ですか？

ちょっとくどい言い方しましたが、レスが付かない質問にはそれ相応の伝わらなさがあるから、という事は覚えておくとよいです。

(function(){
var docA = app.documents[0];
var docB = app.documents[1];
docA.pages[0].duplicate(LocationOptions.AFTER ,docB.pages.lastItem());
})();
ブック機能を使わないでスクリプトでやるのなら
こんな感じですかね。
スタイルの競合だったりいろいろ考慮しなきゃいけないこともありそうですが、duplicateでドキュメントをまたいでページの複製をしてやればいいと思います。