PDF出力

インデザイン２．０Ｊでブック作成中です。
一つのブックに４つのドキュメントを入れて管理しており、
入稿時はPDFの予定です。今日そのブックを一括して
PDFに書き出しました。ブックのプリフライトでも
エラー無しだったので。
ですが、プリンタで印刷すると、ブック内のある１つの
ドキュメントのいくつかのページが非常に不鮮明な印刷に
なります。解像度が低い感じです。写真も多用しているのですが、写真があるからといってぼやけているわけではなく、
写真のあるページでも高解像度のページもいくつかあります。同じ連続したページ内でどうして印刷の際解像度の違いがあらわれるのでしょう？ちなみに、ブックに対してのPDFスタイルを設定して居ますので書き出され方は同じはずです。
自分で気になることと言えば、300dpiと400dpiの写真が混在していること。それからtifとeps形式が混在していることくらいです。
どなたか解決策をご教示ください。今週入稿しないと間に合わないのです。お願いします。

そのPDFを画面上で見た状態でも解像度の違いがありますか？

InDesignからPSファイルを書き出し、それをDistillerでPDFにした場合はどうですか？

Acrobat 6.0をお持ちでしたら、プリフライトをしてみるとどうでしょうか？

昨日はプレビュー機能でプレビューし、印刷していたのですが、
Adbe Readerにて表示、印刷したところ色の問題は解決できたようです。原因は不明です。ただ今度はフォントの問題で
”「いくつかの埋め込みフォント」がうまく印刷できない”
という注意がでるのですが、これは当方が」使用している
インクジェットのプリンタの性質のせいでしょうか？
実際に製本するにあたり、原稿データの入稿で大丈夫なのか
どうか不安です。どなたかおわかりになりますか？