リンクが更新されない

お世話になります。
MacOS10.4.11+InDesignCS4の組み合わせで使用しています。
リンクファイルはaiファイルで、リンクファイルに変更があった時に、
inddファイルを開く時リンクの更新アラートがでますが、
更新を選択しているにもかかわらず、更新されない。
リンクファイルは、aiファイル（100K～200Kくらいの軽いファイルです）をinddファイル（4～5M）1つにつき1～3個配置しています。
実際にはaiファイルは上書きされているので、古いデータはありません。
これはinddファイルがなんらかの形で古いデータを保持しているからだと思いますが、これは自動更新後、別名保存して再度開くと直るのでしょうか?
また、リンクパレットでは特にアラートはでていませんが、フォルダに再リンクを選択することにより、正しいリンクになりますか?
今現在同じ環境で同じファイルでの作業でも、このリンクが更新されたように見えて更新されていない現象が、おこったりおこらなかったりするため、うまく検証ができません。
お手数で申し訳ございませんが、似たような事象を経験された方、どう対処されたのか教えていただけると幸甚です。