Indesign CSでのPDF作成

お世話様です。
教えていただきたいのですが、MAC G5にてIndesign CSで作成したペラものですが、
IndesignのPDF書き出しプリセットでPDF作成
すると、レイヤーで文字版に設定した部分のみ、
微妙にズレが生じてしまいます。
毎回同じ方法を行っているのですが、今回が
初めてのことです。
原因には何が考えられるでしょうか。

試しに、InDesignからPSファイルを書き出し、
DistillerでPDFを作成してみるとどうでしょうか？
InDesignで生じたズレが、解消されるか確認してみて下さい。

ありがとうございました。
とりあえず、ズレは解消されましたが、
埋め込みFontの中で、
「ShinGoPro-Bold-90pv-RKSJ-H-Identity-Hを
抽出できません」とのメッセージが出て、この
書体のみ化けてしまいます。
Distillerについては詳しくないので、
設定の不備か何かでしょうか。

それと、先にズレを想定してレイアウトを
修正し、それをPDFに変換するという手段を
とってみたのですが、その際、わかったことは
ズレというより、そのレイヤーのみ、微妙に
拡大されている、ということでした。
特に他のファイルと異なった方法を取っている
わけでもなく、このファイルのみの現象なので
原因が全くわかりません。
とりあえず、お教えいただいた方法で、
解消することはわかったのですが。