解像度について

いつもお世話になっております。
場違いなのかもしれませんが、
解像度についてよくわからずご質問させていただきました。
長い質問になるのですが、もしよろしければご教授ください。

学校の課題でPhotoshopCS6を使用して地図を作成し、
それをinDesignに配置して入稿しようと考えているのですが、

→国土地理院から25000分の１の地図データ（TIFF、RGB、300dpi）をダウンロード
→Photoshop上で４～５枚をつなげて合成（サイズが横幅1000mmぐらいの大きさになる）
→トーンカーブで調整
→グレースケールに変換
→モノクロに（50％を基準に2階調にわける）に変換
　出力の解像度1200dpiに設定
→等高線のみみえる地図データにした後、スミ100％の等高線を全選択
→CMYKに変換し、その等高線に色をつける

という作業をしております。

その後
→地図の大きさは解像度を1200dpiに保ったまま
　Ａ４程度の原寸サイズにリサイズ
→さらにそのデータに湖（水色）や草原（緑色）などPhotoshop上で色をつけ、
　ちょっとだけこった地図をつくる

という流れです。


で、ここからご質問なのですが、
いろいろ本やネットを調べると、 冊子などでカラー印刷をする際
カラー画像は350dpi、モノクロ画像は1200dpiなどが基本とあるのですが、
このPhotoshopのカラーデータは1200dpiではなく、350dpiに変換したほうがいいのでしょうか。
ただ、１度変換してみたらモヤモヤした画像になってしまうので、1200dpiのままで入稿しようかと思うのですが、
CMYKで1200dpiの画像は印刷的に問題が出てくるでしょうか。
今回の場合は写真データなどではないので大丈夫なのでしょうか。

根本的なことがわかっておらず、変な質問かもしれないのですが、
ちょっとわからず、もしご教授いただけたら幸いです。
作業的に問題などもあったらご指摘ください。
よろしくお願いいたします。

この場合は、モノクロの画像（tiffかpsdにする）をInDesignに貼り付けて、InDesign上で色を付け、湖とか草原の画像を別に作って、InDesign上で重ねるのが良いのでは？

線画とかアニメ絵みたいなのは、350dpiだとシャープでエッジのたった感じにならないことが結構あるので、もっと解像度の大きな状態で作業をした方がいいでしょうね。
このへんのノウハウは、漫画をPCで作画してる人たちのサイトトカを見たほうが詳しいです。
カラーでも600dpiとか800dpiとかでやってたりします。

ガガントスさん

お返事ありがとうございました。
なるほど、画像を重ねるという発想がなかったので、
等高線の画像（1200dpi or 600dpi）のうえに、
色をつけた画像（350dpi）をindesign上で重ねるなどの方法で
やってみようかと思います。

漫画の作画の件も教えてくださりありがとうございました。
そういったサイトも見てみます。
ありがとうございます！