ファイルをきれいに統合したい

CS6です。

2つのファイル（ファイル1・ファイル2）を1つに統合することになりました。
しかし、ファイル1へ、ファイル2のページをページのアイコンをドラッグするやり方で移植すると、ファイル1のマスターアイテムと、ファイル2のページのオブジェクトが重なってしまいます。
うまく統合させるには、どうしたらいいのでしょうか。

状態としては、
・どちらのファイルにも同じ名前のマスターページがある。
・それぞれのファイルで、ページがとびとびになっている。
例：ファイル1＝p1〜10、13、15〜30・・・／ファイル2＝p12、p14、p31〜60というかんじ（ファイル1＝p1〜50、ファイル2＝p51〜52というようにきれいに分かれていないので、1回の移植ではすまない。）


試してみたのですが、
ファイル2のマスターの名前を変えてみると1回目の移植では重ならないようにはできますが、
2回目の移植の時は、ファイル1にファイル2と同じ名前のマスターがあるので、重なってしまいますね…。（当たり前ですが。）

理想的なのは、統合した後も、できればファイル1のマスターページが2種類で適用されているというような状態です。でも拘っていないので、そうならなくてもいいのですが。

では、よろしくお願いします。

1回目はうまくいくのでしたら、1回で全部移動して、それから並べ替えればよいのでは？

あるふぁ様
>1回で全部移動して、それから並べ替え
それも考えました。
しかし…実は、ファイル1・ファイル2、それぞれ200ページずつあるような状態でして。例に書いたぐらいの混在でしたらいいのですが、入れ替えがもっと煩雑なのです…。
最後の手段として、その方法をとるしかないのかもしれませんが、
いい方法をご存知の方がいればお聞きしたいと思いました。

あと、今はマスターの種類が2つのファイルで合計2種類なのですが、統合することでマスターページがダブって4種類になるのが、ちょっとすっきりしないのです。

すっきりした方法は無いんじゃないですかねぇ…。
ページの並べ替えでも、ページパネルアイコンのドラッグアンドドロップだけじゃなく『ページを移動』コマンドとか使えばそれほど手間が増えるとも思えないですけど

あるふぁ様
一括移行→各ページを「ページの移動」だったら、
ドラッグアンドドロップより煩わしさは軽減されそうですね。
この方法がもっともシンプル（？）なようなので、これでやってみようと思います。ありがとうございました。