配置したEPSがおかしくなる

お世話になっております。
配置したEPSデータ（イラレ・フォトショップ形式問わず）をコントロールバーで拡大・縮小などをするとき入力した%のサイズにならないことがよくあります。
例えば、縦横40%縮小したいのにコントロールバーで入力する勝手に大きくなってしまいます。
またコントロールバーでの入力だけでなく拡大・縮小のボタンを押しても似たようなことがあります。

何か解決策があれば教えて下さい。

環境はOS10.2.8～10.4.0、CSです。