EPSへの書き出し

いつも拝見させていただいております。

WinXP IllustratorCS2を使用しています。
AI（色を黒→白へ変更後）→EPSへ書き出した画像をInDesignへ配置すると、
”このコマンドは、多数のページアイテムを作成しパフォーマンスを低下させます。データは、埋め込まれたEPSファイルを配置します。”という警告のようなものが出てしまいます。
色の変更をする以前のものをEPSへ書き出した場合はこの警告は出ませんでした。
どなたか、原因などご存知の方がいらっしゃいましたら教えてください。
よろしくお願い致します。