あれから色々調べたのですがadobeのサポート
データベースにものっていませんし。
ただフォーラムの中に同じ内容があったのですが(OSはわかりません)
解決には至っていないようです。
ちなみにInDesign2.02も同じようなプリンタのダイアログですが
こちらは全く問題ありません。
イラレCSの場合、どの出力機を使っても同じですし、プリンターの問題ではなく、OS(2000)かソフト(イラレCS)のように思います。
CSをお使いの皆様、仮にもしお手持ちのプリンターのデフォルトが
A4のトレイ出力で、それを手差し出力に変えてプリントした後、
もう一度プリントする時に(データを閉じずに)デフォルト(A4トレイ出力)にはもどっていないですか？
又お手持ちのカラープリンターでデフォルトがカラーの時にグレースケールで出力した後もう一度そのまま出力しようとしたらカラーにかわっていないですか？

3537の、「初心者」さんへの書き込みにもコメントしておきましたが、アドビのサポートにも、該当項目が無いようですね。

3MIさんご指摘のように、CS特有のバグかも。
マイナーアップデートを待つしか無いと言うことでしょうか。

ありゃほんとだ。今まで気がつきませんでした（＾＾；）。これはめんどくさいですねぇ。
うちのはXP、ゼロックスのカラーレーザーです。ソフト側の問題でしょうねぇ。
何とか早く改善してもらいたいものです。