OSのVer.（9.x/10.2.x/10.3.xなど）が書かれてないのですが、
状況からして9.xではないかと推測します。
それならば、メモリ割り当て増やすなど行ってみたり、
起動直後などの出来るだけ安定した状態で行うのが良いかと。
ちなみにAI9形式は、有無を云わさずPDF互換形式です。

どのみち、下位保存自体は避けた方が無難です。

あと、使用バージョンは末尾の数字までお願いします。

レスありがとうございます。

OS ver9.1
Illustrator ver10.0.1
メモリ割り当て　98000k
で、作業しております。
ai9がpdf互換形式なのは存じておりますが、
作業途中でaiアイコンがpdfのアイコンに変わってしまうのは
クリエータかFiletypeが勝手に変わってしまう。ととらえて
よろしいのでしょうか。
上記の環境で安定動作を求めるのは無理でしょうか。

外部で出力をお願いする直前に
下位保存のファイルを新たに作る方が良いんでしょうね…

とりあえず、10.0.3にアップデートしてから
もう一度確認してみてください。

OS9環境だと、200MBくらい割り当てても、
状況によってはまだ不足しているくらいだと思います。
ファイルタイプ・クリエータの状態は、直接そのファイルを
ResEditなどで確認したほうが早いような。

個人的には、Illustrator10はOS Xでの運用の方が向いていると思います。
マシンスペックやフォント周りが許すのであれば、
良い機会なので乗り換えてもいいのではないかと思いますよ。

あと、ネイティブファイルやPDF/X-1aでの出力依頼できるところを
探してみるというのも必要な時なのかもしれませんよ。

10.0.3にアップデートとメモリ割り当て増やすのを
試してみます。

乗り換える余力が…ありません。
印刷用版下作成以外の作業に使用中の周辺機器を
新たに対応機種に換えるのも難しいので…
なんとか今の環境でがんばってみます。

ありがとうございました。